儀器簡介:
高通量組織研磨機
SPEX GENO 2010 GRINDER®高通量組織研磨機是杜邦先鋒公司專門為農(nóng)業(yè)植物樣品合分子生物學(xué)方面研究而研發(fā)的一款新型高通量組織研磨機。通量接近400,可一次同時研磨384 個樣品,因而特別適用于植物和動物組織中核酸、蛋白質(zhì)和其它成分的提取。研磨樣品包括植物的根、莖、葉、花、果、種子和某些動物組織;另外它還可以對酵母、培養(yǎng)的動物細(xì)胞、細(xì)菌細(xì)胞等進行破碎,從而提取其中的組分。
由于采用了無二的垂直上下震動模式,GENO 2010研磨的樣品具有研磨更加充分、更均勻、樣品重復(fù)性更好、樣品之間沒有交叉污染等優(yōu)點,是真正的高通量組織研磨機。
植物組織核酸提取
為了從完整種子中分離核酸,需要先用機械粉碎的方法破碎種子,再提取和純化核酸。通常的機械破碎方法是人工采用研缽和杵進行研磨的方式;但是,這種方法并不適合高通量的種子破碎,因為人工研磨速度很慢而且研缽和杵的重復(fù)使用也容易導(dǎo)致交叉污染。用GENO對微孔板中的種子進行機械研磨,可以同時使核酸從大量種子細(xì)胞中釋放出來;再用傳統(tǒng)的分離方法就可以從勻漿液中純化出核酸。用水浸泡過夜的大豆可在3分鐘內(nèi)高效一致地被均質(zhì)化,所得漿液可以作為DNA分析的材料來源。
從培養(yǎng)的細(xì)胞中快速提取基因組DNA為PCR分析做準(zhǔn)備
在科學(xué)家的研究和診斷過程中,PCR大大提高了對核酸進行檢測和定量測序的效率。但是,因為PCR方法通常需要在模板擴增前有一個純化步驟,因此這個過程并不快。純化步驟包括細(xì)胞收集和核酸的溶解,接下來還要用層析樹脂把核酸從裂解液中分離出來。雖然這些純化方法已經(jīng)很大的發(fā)展,但是它們?nèi)匀恍枰馁M大量時間;而且,大量重復(fù)的試驗可能會耗費大量昂貴的材料。
GENO技術(shù)能夠一次快速而低成本地破碎大量培養(yǎng)的細(xì)胞,從而為后期對基因組DNA進行PCR分析而做準(zhǔn)備。用GENO對微孔板中大量的培養(yǎng)細(xì)胞進行高通量均質(zhì)化,再通過層析樹脂對核酸進行純化,并進行PCR分析,能大大提高基因組分析的效率。
酵母的96孔高通量破碎
多年的生物化學(xué)、基因組學(xué)和分子生物學(xué)研究取得的豐富信息表明,酵母已經(jīng)成為生物系統(tǒng)研究的模式型和生物系統(tǒng)研究的模式生物和生物藥學(xué)家的有力工具。酵母已成為基因表達(dá)研究和蛋白質(zhì)重組表達(dá)的通用宿主,包括Picbia、Hansenula、Debaryomyces均被研究者所使用,但使用的仍然是Saccbatomyces酵母。
酵母mRNA和細(xì)胞內(nèi)蛋白通常很難用傳統(tǒng)的酶解方法從細(xì)胞中完整地提取出來。裂解酶中通常含有核糖核酸酶和其他蛋白,它們不僅會攻擊細(xì)胞壁,而且會攻擊特定的分子。並且,由酶解產(chǎn)生的原生質(zhì)體通常需要借助一定的試劑進行溶解而導(dǎo)致很多蛋白貭變性失活。因此,通常需要采用機械的方式破碎酵母細(xì)胞從而釋放其內(nèi)溶物。
機械破碎酵母傳統(tǒng)上採用壓榨機或球磨機。這兩種方法中都是單樣品操作的。對那些需要大量酵母克隆在一個高通量篩選環(huán)境中的檢測實驗來說,單樣品操作是個瓶頸並且是不切實際的。因此,需要一種方法可以高通量的機械分裂細(xì)胞。GENO一開始為深孔版中破碎種子而設(shè)計的球磨機,現(xiàn)在被用來在微孔版中對酵母進行破碎。
細(xì)菌細(xì)胞的裂解(嗜鹽菌和桿菌)
GENO能通過機械碰撞的方式裂解細(xì)菌細(xì)胞。以格蘭氏陰性耐鹽菌Halomonas elongate和格蘭氏陽性桿菌為模式研究對象,SPEX已經(jīng)發(fā)展了相應(yīng)的兩種技術(shù):細(xì)菌培養(yǎng),收獲并沖洗掉多余的培養(yǎng)基,將細(xì)胞懸浮于微孔版中的鹽水溶液中,在研磨界質(zhì)存在的情況下用GENO對細(xì)胞進行震蕩破碎,6-9分鐘就能夠釋放足夠量的核酸,進行后續(xù)試驗。
應(yīng)用領(lǐng)域
分子標(biāo)記輔助育種、基因組學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)核分子進化、轉(zhuǎn)機因研究及其他生化研究領(lǐng)域。美國藥物食品管理局USFDA及環(huán)保署USEPA采用GENO作為殘留農(nóng)藥測試或有毒物質(zhì)樣品前處理,效率增加3-5倍,通量速率增加3-5倍,準(zhǔn)確性以及在現(xiàn)性大幅提高。
技術(shù)參數(shù):
1. 設(shè)備尺寸:15 in.(38.1 cm)x20.49 in.(52 cm)x25.25 in. (64.1 cm)
2. 重量:60 1bs.(27.24kg)
3. 功率:1/3馬力
4. 電源線:230V/50Hz兩相
5. 夾具行程:3.2cm(垂直)
6. 夾具速率:500-1750次/分鐘可調(diào)
7. 安全特征:兩道安全鎖、開蓋停止運作,兩程密封夾
8. 定時器:數(shù)字顯示為分:秒,值為5:00
主要特點:
• 杜邦旗下先鋒良種與SPEX共同開發(fā)設(shè)計,為專門為農(nóng)業(yè)植物樣品而研發(fā)的一款新型高通量組織研磨機
• 是提取植物樣品中核酸,蛋白質(zhì)其分析成分的經(jīng)過特殊設(shè)計的研磨機
• 高通量:使用大夾具(2199)可同時研磨至384個樣品,并可適用于多種尺寸樣品的研磨,極大提高了工作效率
• 為了保證樣品的重現(xiàn)性、有效性、可比性,研磨機可設(shè)置時間、速率和循環(huán)次數(shù),保證每次研磨和下一次研磨條件的一致性,時間3分鐘,速率1500 rpm。
• 有安全鎖裝置,一個充氣的氣缸鎖使蓋子穩(wěn)固,用起來十分安全。
• 常溫、低溫動植物樣研磨專家
樣品容器
雖然GENO的夾具是為夾住兩個標(biāo)準(zhǔn)的深孔板而設(shè)計的,但是它也能適合于具有相同尺寸(5inchx3inchx2inch)的任何東西。這包括具有更少或更多樣品孔的深孔板、固定多個獨立小瓶的支架、和其它可能的構(gòu)件。另外,夾具也能適用于高度在2.25inch內(nèi)的不同樣品容器。
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