NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫旨在用作使用體外轉(zhuǎn)錄 (IVT) 進行核糖核酸 (RNA) 對照合成的模板。

NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫旨在用作使用體外轉(zhuǎn)錄 (IVT) 進行核糖核酸 (RNA) 對照合成的模板。這些 RNA 對照旨在用作外部對照或“加標(biāo)”對照，通過對基因表達測量的技術(shù)性能進行定量評估來支持基因表達測定的可信度。

一個 SRM 單元包含 96 個不同的 0.5 mL 聚丙烯管，其中通過吸光度 (A260) 測量，每個脫水質(zhì)粒脫氧核糖核酸 (DNA) 約為 10 µg。每個試管都含有質(zhì)粒 DNA，其具有*的模板序列，用于不同的外部 RNA 對照。這些控制是與外部 RNA 控制聯(lián)盟 (ERCC) 合作開發(fā)的。

NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫這些模板可以很容易地用于制作 RNA 控制（參見圖 1）。根據(jù)轉(zhuǎn)錄的鏈，對照將模擬“有義”或“反義”真核信使 RNA (mRNA)。當(dāng)用于制造有義對照 RNA 時，每個對照在 3' 端將有一個標(biāo)稱的 24 個核苷酸 (nt) 多聚腺苷酸 (polyA) 片段。由它們產(chǎn)生的 DNA 模板和 RNA 轉(zhuǎn)錄本在圖 2 和圖 3 中進行了注釋和描述。對照序列范圍從 273 nt 到 2022 nt，GC 分?jǐn)?shù) (1) 有兩種群體分布，一種以 35% GC 為中心，另一種以 47% 為中心。

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