單細胞測序技術(shù)起始核酸材料極少，步驟比普通NGS繁雜，實驗周期更長，難度和風險也更大。重現(xiàn)性和成功率是一大考驗。單細胞測序方法眾多，除了商品化試劑盒，許多研究人員也會針對自己關(guān)注的特征開發(fā)全新的技術(shù)。另一方面，開展腫瘤異質(zhì)性等針對細胞群體的研究越來越普遍，這需要對大批量細胞進行逐一的測序和解析。如果按照試劑盒常量/rxn，手工完成每一個細胞的實驗，勞力和成本都難以承受。
Echo硬核的聲波移液技術(shù)技術(shù)，通過能量控制準確的納升級液體轉(zhuǎn)移，噴射液滴單位可以低至2.5 nL。其非物理接觸、準確小量移液、高速度的特征，決定了Echo非常適合解決單細胞測序中遇到的超高通量、技術(shù)靈活多變、反應(yīng)scale-down成本控制、交叉污染等問題。
非物理接觸
· 樣本完整性
· 無吸頭消耗
· 降低交叉污染風險
移液的靈活性
· 2.5 /25 nL 每滴
· 200-500 滴/秒
· 任意孔至任意孔移液
移液條件溫和
· DNA/RNA/蛋白等生物大分子
以結(jié)合SMART-Seq cDNA文庫制備及Nextera XT 測序文庫制備的單細胞RNA-seq實驗為例。SMART-Seq反應(yīng)體系(50 uL)可以由Echo縮小4，5，8，10，16，20至32倍，Nextera XT 試劑盒可縮小10倍(50 uL至5 ul)使用。值得注意的是，SMART-seq cDNA文庫制備中，常量反應(yīng)總體積為50 ul, 縮小32倍后反應(yīng)總體積僅僅只有1.75 uL，還不及一個常量反應(yīng)中逆轉(zhuǎn)錄酶使用量大。借助Echo，一個96 rxn的試劑盒將具備完成3072 rxn的可能。
Echo可以完成
● 微量化的單細胞基因組放大3
● 微量化的單細胞測序文庫制備
● 微量化的文庫濃度質(zhì)控
● 一步法文庫Normalization&Pooling
● Better together—— Echo plus Biomek自動化單細胞測序方案
基于Echo的單細胞文庫制備不受待測細胞數(shù)目的限制，支持各種試
Better together—— Echo plus Biomek自動化單細胞測序方案
基于Echo的單細胞文庫制備不受待測細胞數(shù)目的限制，支持各種試劑盒的靈活組合和NGS建庫方法學(xué)DIY。做你想做的，測你想測的，提供scale-down的微量化反應(yīng)體系和scale-up的自由度。
將Echo聲波移液工作站與Biomek i-系列自動化工作站結(jié)合，可實現(xiàn)更高自動化程度的單細胞測序?qū)嶒灐cho完成文庫制備中涉及的微量化反應(yīng)體系構(gòu)建， 由Biomek自動化工作站配合實現(xiàn)文庫 Agencourt SPRIselect磁珠PCR clean-up和片段篩選。實驗流中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)均可查可溯，保證文庫信息安全可靠。
參考：
1. US Patent 6938987
2. US Patent 6938995
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